La FADS est signataire d’un contrat de prestations avec l’Etat de Neuchâtel. Ce document règle le financement annuel allouée par l’Etat pour les prestations sollicitées par ce dernier (cf. missions). La subvention versée couvre entre 35 à 40% du budget.

Le solde des revenus provient de la facturation des prestations directement au bénéficiaire. Comme 95% des personnes hébergées ou accompagnées par la FADS sont à l’aide sociale, ce sont les services sociaux régionaux (SSR) qui financent ces prestations. Ce financement émarge à la facture sociale du canton de Neuchâtel.

La FADS, comme fondation reconnue d’utilité publique, peut recevoir des dons qui sont exonérés.

La Loterie Romande soutient certains projets ou investissements exceptionnels comme du mobilier et la réalisation du nouveau site Internet.